یک پست خیلی قدیمی توی این وبلاگ هست، درباره این نرم افزار که به نظر میاد خوشبختانه مورد توجه قرار گرفته.
در نسخه جدید این نرمافزار ( ( Version 1.9 (2011-03-14 ) فایلهای خروجی نرمافزار لمپس (LAMMPS) هم جزو فایلهای استاندارد ورودی قرار گرفته و میتونیم با لود کردن یک dump فایل و انتخاب نوع (LAMMPS trajectory) به عنوان نوع فایل ورودی، نتایج شبیه سازیهای لمپس رو هم بدون مشکل با VMD ببینیم.
اگر سیستم عامل کامپیوتر شما لینوکس ۳۲ بیتی است، کافیست فایل نسخه
را دانلود و نصب کنید.
یک مشکلی در نصب این نرمافزار روی سیستم اوبونتوی ۱۰.۰۴ داشتم که به کمک دکتر سید علایی رفع شد. برای نصب اون احتیاج به OpenGL هست، و اون چیزی که برای نصبش لازمه نسخه libgl1-mesa-swx11 و بستههای مربوط به اون هست. من قبلا OpenGL داشتم ولی نسخه دیگری بود، که با VMD همخوانی نداشت و که پس از نصب، موقع اجرا ایراد میگرفت. پس از نصب libgl1-mesa-swx11-i686، libgl1-mesa-swx11، libosmesa6، و x11proto-gl-dev مشکل حل شد.
لازم به ذکر است که نسخه جدید CUDA رو هم پشتیبانی میکنه و اگر یکی از کارتهای گرافیکی انویدیا با قابلیت کودا داشته باشید، میتونید حظ وافر از سرعت اون ببرید.
واژگان:
Linux, Ubuntu
در نسخه جدید این نرمافزار ( ( Version 1.9 (2011-03-14 ) فایلهای خروجی نرمافزار لمپس (LAMMPS) هم جزو فایلهای استاندارد ورودی قرار گرفته و میتونیم با لود کردن یک dump فایل و انتخاب نوع (LAMMPS trajectory) به عنوان نوع فایل ورودی، نتایج شبیه سازیهای لمپس رو هم بدون مشکل با VMD ببینیم.
اگر سیستم عامل کامپیوتر شما لینوکس ۳۲ بیتی است، کافیست فایل نسخه
را دانلود و نصب کنید.
یک مشکلی در نصب این نرمافزار روی سیستم اوبونتوی ۱۰.۰۴ داشتم که به کمک دکتر سید علایی رفع شد. برای نصب اون احتیاج به OpenGL هست، و اون چیزی که برای نصبش لازمه نسخه libgl1-mesa-swx11 و بستههای مربوط به اون هست. من قبلا OpenGL داشتم ولی نسخه دیگری بود، که با VMD همخوانی نداشت و که پس از نصب، موقع اجرا ایراد میگرفت. پس از نصب libgl1-mesa-swx11-i686، libgl1-mesa-swx11، libosmesa6، و x11proto-gl-dev مشکل حل شد.
لازم به ذکر است که نسخه جدید CUDA رو هم پشتیبانی میکنه و اگر یکی از کارتهای گرافیکی انویدیا با قابلیت کودا داشته باشید، میتونید حظ وافر از سرعت اون ببرید.
واژگان:
Linux, Ubuntu
۱ نظر:
سلام
من روشی رو که گفتید در ورژن 1.9.1 هم در ویندوز و هم در لینوکس امتحان کردم اما جواب نداد
فایل خروجی لمپس من با دستور dump custum تولید شده و شامل id x y z vx vy vz هست. اگه ممکنه منو راهنمایی کنید. ممنون
ارسال یک نظر